Projekt Agroecology je postavený na trinástich hlavných princípoch:
- Recyklácia. Prednostne využívať miestne obnoviteľné zdroje a čo najviac uzatvárať kolobeh živín a biomasy.
- Znižovanie vstupov. Znižovať alebo úplne eliminovať závislosť od nakupovaných vstupov.
- Zdravie pôdy. Zabezpečiť a zlepšovať zdravie a funkčnosť pôdy na podporu rastu rastlín, najmä prostredníctvom riadenia organickej hmoty a podpory biologickej aktivity pôdy.
- Zdravie zvierat. Zabezpečiť zdravie a dobré životné podmienky zvierat.
- Biodiverzita. Udržiavať a zvyšovať druhovú rozmanitosť, funkčnú diverzitu a genetické zdroje a zachovávať biodiverzitu v agroekosystéme v čase aj priestore – na úrovni poľa, farmy a krajiny.
- Synergia. Posilňovať pozitívne ekologické interakcie, synergiu, integráciu a komplementaritu medzi prvkami agroekosystémov (rastliny, zvieratá, stromy, pôda, voda).
- Ekonomická diverzifikácia. Diverzifikovať príjmy na farme tak, aby mali malí poľnohospodári väčšiu finančnú nezávislosť a možnosti pridanej hodnoty a zároveň mohli reagovať na dopyt spotrebiteľov.
- Spolutvorba poznatkov. Podporovať spoluvytváranie a horizontálne zdieľanie poznatkov vrátane miestnych a vedeckých inovácií, najmä prostredníctvom výmeny medzi farmármi.
- Spoločenské hodnoty a strava. Budovať potravinové systémy založené na kultúre, identite, tradíciách a sociálnej a rodovej rovnosti miestnych komunít, ktoré zabezpečujú zdravú, rozmanitú, sezónne a kultúrne primeranú stravu.
- Spravodlivosť. Podporovať dôstojné a stabilné živobytie pre všetkých aktérov potravinových systémov, najmä malých producentov, na základe spravodlivého obchodu, férového zamestnania a spravodlivého zaobchádzania s duševným vlastníctvom.
- Prepojenosť. Zabezpečiť blízkosť a dôveru medzi producentmi a spotrebiteľmi podporovaním spravodlivých a krátkych distribučných reťazcov a znovuzačlenením potravinových systémov do miestnych ekonomík.
- Správa pôdy a prírodných zdrojov. Uznávať a podporovať potreby a záujmy rodinných farmárov, drobných roľníkov a maloproducentov potravín ako udržateľných správcov a ochrancov prírodných a genetických zdrojov.
- Účasť. Podporovať spoločenskú organizáciu a širšiu účasť producentov a spotrebiteľov potravín na rozhodovaní s cieľom posilniť decentralizované riadenie a miestne prispôsobené spravovanie poľnohospodárskych a potravinových systémov.